尽管蜂蜜经常被用作多种疾病的自然疗法，但有些人会对它产生过敏反应。研究表明，对植物花粉和蜂刺毒液过敏或敏感的人有发生蜂蜜过敏的机会。对蜂蜜的过敏反应的严重程度和症状会有所不同，具体取决于蜂蜜的种类和类型。当触发免疫机制将无害的过敏原识别为有害的并做出反应以保护身体免受其伤害时，就会发生过敏反应。对蜂蜜的过敏反应可以通过食用甚至在某些情况下与皮肤接触而引发。
瘙痒
皮肤通常与过敏反应有关，个体会在全身出现全身瘙痒，形成红色的肿胀斑块，这些斑块在数小时后消失，不会留下疤痕或效果。马里兰大学医学中心还列出了荨麻疹，它是皮肤上凸起的红肿，是对蜂蜜过敏反应的皮肤症状。
呕吐和腹泻
过敏反应导致免疫系统由白细胞产生称为IgE抗体的化学物质。抗体会迅速将摄入的蜂蜜检测为体内有害物质，并引起免疫反应。克利夫兰诊所列出了胃肠道过敏症状，例如腹痛，抽筋，腹胀，恶心，呕吐和腹泻。
打喷嚏
蜂蜜花粉引起的过敏症状是流鼻涕，发痒，持续打喷嚏，喘息和呼吸困难。对蜂蜜和其他过敏原的这种轻度过敏反应是由一种称为组胺的物质引起的，该物质由白细胞释放，导致鼻子和肺部血管扩张和渗漏。这些过敏症状可能会发展为更严重的过敏反应形式，包括某些人的过敏反应，并由于气道狭窄而产生危及生命的症状，如胸痛，胸口收紧和呼吸困难，需要立即紧急治疗。